ローカルとリモートで、違う階層のフォルダにアップされている状況ですね。
DreamweaverのFTP機能では、サイト設定のローカルサイトフォルダとサーバーのルートディレクトリで同じフォルダ階層になるようにファイルをアップします。
そのため、それぞれサイトのトップ階層のデータが入っているフォルダを指定します。
今回の場合ですと、
・ローカルサイトフォルダにはサイト名（ひらがな）のフォルダ
・サーバーのルートディレクトリにはアカウント名.jpのフォルダ
に設定して、同じフォルダ階層にファイルがアップされるかご確認いただけますでしょうか。