私も10.11.5上のDreamweaverで頻繁に検索/置換を使っていますが、クラッシュした経験はないです。指定している条件内容に関係なく、必ずクラッシュする感じでしょうか。
動作が不安定になった場合の一般的な対処方は既に試されましたでしょうか。
Dreamweaverの設定ファイルが損傷している可能性も考えられますので、まずは試してみることをお奨めします。
Dreamweaver のビヘイビアーが異常ですか？環境設定の復元を試行してください。
特定の条件のみクラッシュする場合は、その内容を書いて頂くと助かります。
こちらでも同じ条件でクラッシュするかどうか確認してみたいと思います。