ご返信ありがとうございます。
いただいた内容を元に、再度シンプルな構造のもので試しましたが、やはり改善されません。
フォルダやテンプレート名に日本語や記号なども使用していませんし、ドライブ名も「Macintosh HD」から変更しておらずそのままです…。
ただ、色々試していて気付いたのですが、テンプレート内にライブラリを作成し、そのライブラリを更新すると、それがトリガーとなり、通常通りテンプレートが更新できるようになります。また、一 度テンプレート機能が回復すると、ライブラリを切り離しても問題なく更新できています。
質問時に書き忘れてしまっていましたが、もしかしたらMacOS High Sierraのマイナーアップデートの影響かもしれません。
マイナーアップデート前は問題なかったので…。