早速の情報ありがとうございます。
まず、日本語入力はON、OFFで症状は変わりません。（いずれも発生します）
音声入力は確認したところOFFになっていました。
数字入力はテンキーか否かでは変化ありません。
また、参考となりますが、以下の別環境、別操作でも再現できました。
環境
・MacBook Air (13-inch, Mid 2012) High Sierra 10.13.6 （US配列キーボード）
・こちらはKarabiner-Elementsはインストールしていません。
操作
同パネルの入力フォーカスを tabキーで移動し、
未設定の項目で、数値入力を試みると１文字入力で２文字同じ文字が入力されます。
（設定済みの項目では発生しません）
また情報などありましたらよろしくお願い申し上げます。