コメントありがとうございます！
すみません、確かに情報がざっくりし過ぎていました。
例えば……
（1）ライブビューで、修正箇所をWクリック。
（2）アクティブになったところで、日本語の修正など、テキスト編集。
（3）修正したところで、別の所をクリック or Ctrl+Enterで修正箇所を非アクティブに。
ここでは修正が反映されている状態。
（4）Ctrl + S で保存
（5）ページ内の<span>が消える。
という具合です。
消える際は、綺麗（？）に消えます。
<p><span class="XXX">テキストテスト</span>テキストテキスト</p>
↓
<p>テキストテストテキストテキスト</p>
スプリットビューでも、コードを直に編集する分には、
上記の現象は起こらないので、どうにもならない事はないのですが、
原因が分からない気持ち悪さはあります。