問題が解決してなによりです。
js/bootstrap.js は bootstrapコンポーネントの表示処理のために使用されるものですが、一般的に </body> タグの直前に1つあれば良いとされています。
これが原因ということであれば、</body> タグの直前にあるものだけを1つ残す形がよろしいかと思います。
同様に、js/jquery-1.11.3.min.js も複数のものがページ内で使用されていますので、これも1つだけにした方がより無難かと思います。
動作しているのであれば問題ないともいえますが、ご参考までに。