Dreamweaver CS6に、Add-onは関係ありません。
CS6にはアプリケーション自体にBusiness Catalystの拡張機能は組み込まれていますので、CCへのアップグレードが必要なわけではありません。
一度Adobe Extension Manager CS6を開いて、DWの項目で不要な.mxpがあったら削除します。
また、再現する場合はVistaでしたら以下のキャッシュファイルをConfigurationフォルダから削除してください。
WinFileCache-********.dat
- Windows Vista: C:\Users\<user>\AppData\Roaming\Adobe\Dreamweaver CS6\ja_JP\Configuration
上記をお試しになり、新規Business Catalystサイトの作成をしてみてください。