ご指摘ありがとうございます。
パッケージのところに
「このAdobe Dreamweaver CS4アップグレード版は、Macromedia Dreamweaver（MX2004、8）およびAdobe DreamweaverCS3の日本語版正規ライセンスユーザの方のみインストールしていただけます。」
という記載がありましたので、MX2004からもアップグレードできると考えてしまいました。
また中身のDVDが異なっているというのも考えにくいのですが、このままインストールが難しそうであれば新版を購入する方向で上司に相談したいと考えております。