ホームページビルダーで作成されたファイルも、同じテキスト形式のHTMLファイルですので、Dreamweaverで引き続き編集することが出来ます。
気になる点としては、Dreamweaverで編集したファイルを元のホームページビルダーで編集しようとした場合、もしかしたらホームページビルダーではホームページビルダー専用の機能が動 かなくなってしまうことは考えられます。
編集をせず、単純にアップロードしたりダウンロードしたりということだけであれば、気にせずDreamweaverで管理可能です。
それぞれ別の会社の製品ですので、連携を記載した情報はなかなか少ないかと思いますが、以下のサイトの情報などは参考になるかと思います。
http://detail.chiebukuro.yahoo.co.jp/qa/question_detail/q1317654573
http://detail.chiebukuro.yahoo.co.jp/qa/question_detail/q1120225036
http://oshiete.goo.ne.jp/qa/3076398.html
また、Dreamweaverを理解するには以下の解説がとても分かりやすいので、今後Dreamweaverで編集されるのでしたらこちらから始められては如何でしょうか。
https://blogs.adobe.com/creativestation/web-start-dreamweaver-getting-start-01-site-settin gs